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中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海所花鱸育種團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)首個(gè) 花鱸40K SNP液相育種芯片“海鱸1號(hào)”
日期:2025-01-24  來源:中國水產(chǎn)科學(xué)研究院
  種業(yè)是花鱸全產(chǎn)業(yè)鏈的“壓艙石”,是廣東省發(fā)展現(xiàn)代化海洋牧場的原動(dòng)力。目前,雖然花鱸養(yǎng)殖面積和產(chǎn)量逐年增加,但花鱸育種工作依賴傳統(tǒng)育種技術(shù),育種進(jìn)程緩慢,尚無符合現(xiàn)代化海洋牧場產(chǎn)業(yè)化需求,具有速生、抗風(fēng)浪、低餌料系數(shù)等經(jīng)濟(jì)性狀優(yōu)良品種見諸報(bào)端;此外,廣東省乃至全國野生花鱸基因資源污染嚴(yán)重,繁殖所用的南北方花鱸種群混雜,質(zhì)量參差不齊。花鱸種質(zhì)質(zhì)量退化嚴(yán)重,導(dǎo)致生長速度減慢、抗病能力降低、病害頻發(fā),種質(zhì)問題已經(jīng)成為廣東省現(xiàn)代化海洋牧場花鱸種業(yè)的空前挑戰(zhàn),全面開展基因芯片等高效的現(xiàn)代分子育種技術(shù)研究,將有助于加速花鱸育種進(jìn)程,助力現(xiàn)代化海洋牧場建設(shè)。
 
  為解決產(chǎn)業(yè)面臨的“卡脖子”問題,創(chuàng)建花鱸精準(zhǔn)高效育種技術(shù)體系,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所院級(jí)花鱸基因資源評(píng)價(jià)與遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)基于前期自行構(gòu)建的高質(zhì)量基因組數(shù)據(jù),結(jié)合GenoBaits?技術(shù)體系,研發(fā)了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的首個(gè)花鱸40K液相育種芯片“海鱸1號(hào)”。這是一款應(yīng)用于篩選、創(chuàng)制具有速生、抗逆、抗病、抗風(fēng)浪等經(jīng)濟(jì)性狀,且滿足深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖、陸基池塘、工廠化循環(huán)水等多種生產(chǎn)需要的花鱸新品種/系所特制的種業(yè)芯片,能夠?qū)崿F(xiàn)快速、精準(zhǔn)、高效的分子育種,助力花鱸種業(yè)創(chuàng)新發(fā)展。
 
  “海鱸1號(hào)”液相芯片共計(jì)包括279個(gè)GWAS分析性狀關(guān)聯(lián)標(biāo)記,以及41705個(gè)基于遺傳連鎖關(guān)系挑選的基因組均勻分布的背景位點(diǎn),其平均檢出率高達(dá)99.25%~99.71%,分型一致性高達(dá)98.64%,平均覆蓋度為99.21%,平均位點(diǎn)缺失率為0.55%。該芯片具有基因組上均勻分布、多態(tài)性高等特點(diǎn),可以實(shí)現(xiàn)高效的群體劃分、親權(quán)關(guān)系鑒定、分子標(biāo)記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能,且基因分型+全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)周期僅需2周左右,在基因組選擇育種中展現(xiàn)出廣闊應(yīng)用前景。
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