臺灣地區(qū)“食藥署”針對基因改造食品已采取原料源頭邊境查驗及后市場監(jiān)測的雙重管理機制。

    在源頭邊境查驗管理部分，“食藥署”已針對港埠邊境進口報驗項目為非基因改造的大豆及玉米等，在輸入時應檢附產(chǎn)品或原料為非基因改造的證明文件，包括IP （Identity preservation）證明、或其他可證明非基改的官方文件、或檢測項目涵蓋所有已通過查驗登記基改品系的檢驗報告，并依風險管控原則針對抽中批進行檢驗，以強化非基因改造大豆及玉米的進口管理。另如系屬基因改造產(chǎn)品，則應檢附出口國廠商出具的聲明文件，載明該批貨物所含轉殖品系的國際統(tǒng)一編號或通用代號，文件上敘明“This shipment of soybeans may contain genetically modified event as following…”，或相同意義的說明，文件上還須載明可與該批貨物鏈接的信息。

    在后市場監(jiān)測管理部分，“食藥署”依據(jù)境內基因改造食品標示制度的實施，進行年度“臺灣市售基因改造食品標示調查”，每年監(jiān)測約250件市售產(chǎn)品，自2003年（不合格率為57.0%）持續(xù)監(jiān)測至2014年，不合格率已降至7.1%，不符合標示規(guī)定的市售食品，皆函請轄區(qū)衛(wèi)生局依法處辦并輔導業(yè)者進行正確標示。另為落實源頭管理，“食藥署”于2016年度已責成地方政府衛(wèi)生局，針對境內34家資本額3,000萬以上大豆油脂及醬油釀造工廠，針對其黃豆來源及產(chǎn)品標示共查察161項大豆油脂及醬油產(chǎn)品，產(chǎn)品標示皆符合規(guī)定。此外，“食藥署”于2016年度也已規(guī)劃辦理“機關學校福利社及午餐膳業(yè)稽查項目”、“餐盒食品工廠HACCP稽查項目”及“豆制品制造業(yè)稽查項目”，持續(xù)針對校園午餐及食材部分進行基因改造食品標示及來源查核，以保障消費大眾權益。

    “食藥署”提醒業(yè)者，基因改造食品標示的新制已實施，如經(jīng)查獲產(chǎn)品未依規(guī)定標示，依食品安全衛(wèi)生管理法第47條規(guī)定，處新臺幣3萬至300萬元罰款；如標示有不實、夸張或易生誤解等違反同法第28條規(guī)定的情形，依據(jù)同法第45條第1項規(guī)定，處新臺幣4萬元以上400萬元以下罰款。