近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所作物耐逆性調(diào)控與改良創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)從染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)上揭示了秈稻和粳稻的高溫抗性差異機(jī)制,為研究表觀遺傳調(diào)控作物重要農(nóng)藝性狀及提高抗逆性提供了新的研究視角。相關(guān)研究成果發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《BMC Biology》(BMC生物學(xué))上。
據(jù)專(zhuān)家介紹,染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)與基因組功能高度相關(guān)。目前少數(shù)真核生物中僅報(bào)道了環(huán)境變化對(duì)染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的影響,而作物染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)是如何響應(yīng)逆境脅迫機(jī)制仍不清楚。該研究運(yùn)用三維空間結(jié)構(gòu)測(cè)序(HiC-seq)、染色質(zhì)開(kāi)放性測(cè)序(ATAC-seq)和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)的多組學(xué)聯(lián)合分析,揭示了高溫脅迫下秈稻和粳稻染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律,強(qiáng)調(diào)了從染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)水平深入研究作物脅迫應(yīng)答機(jī)制的重要性。
真核生物的染色質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控和控制多種生物過(guò)程中起著至關(guān)重要作用。該研究揭示了高溫脅迫下秈稻和粳稻的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)差異,并闡明了染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)與基因轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)可及性之間的關(guān)聯(lián)。為水稻表觀遺傳精準(zhǔn)調(diào)控機(jī)制解析和水稻抗性改良提供了一種全新的研究視角。
生物所谷曉峰研究員為論文通訊作者,生物所梁哲研究員和張倩博士研究生為論文第一作者,該工作得到了國(guó)家重大專(zhuān)項(xiàng)、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目資助。
原文鏈接:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-00996-4
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