國際著名學(xué)術(shù)期刊PLoS Pathogens于2021年7月24日在線發(fā)表了上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院朱勃、陳功友聯(lián)合團(tuán)隊研究成果“A key antisense sRNA modulates the oxidative stress response and virulence in Xanthomonas oryzae pv. oryzicola”,揭示了稻黃單胞菌稻生致病變種Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Xoc)中sRNA適應(yīng)氧化應(yīng)激環(huán)境下對水稻致病性的研究機制。
原核生物和真核生物中除了三種經(jīng)典的 RNA,如 tRNA, rRNA,和 mRNA 外,還存在著一類新型的具有重要調(diào)控功能的非編碼RNA(ncRNA),在細(xì)菌中被統(tǒng)稱為 small RNA(sRNA),大小在 50-500nt 之間,主要作用方式是通過堿基互補配對與靶標(biāo)基因 mRNA結(jié)合,進(jìn)而影響 mRNA 的穩(wěn)定性和翻譯從而在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控基因表達(dá)。研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)sRNA Xonc3711通過堿基互補配對靶標(biāo)DNA結(jié)合蛋白Xoc_3982影響其轉(zhuǎn)錄水平,ChIP-Seq表明Xoc_3982能夠與三型效應(yīng)因子XopC2結(jié)合從而影響其致病性。sRNA Xonc3711通過增加生物膜的形成來增加氧化應(yīng)激耐受性和和在水稻上的毒性(圖)。目前對于稻黃單胞菌稻生致病變種Xoc中sRNA的生物學(xué)功能仍處于研究初始階段,因此開展sRNA 的研究,并發(fā)現(xiàn)具有重要功能的 sRNA,對進(jìn)一步揭示細(xì)菌致病機理等和防控所致的植物病害提供了新的思路。
上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院博士研究生吳言和王賽為論文的共同第一作者,上海交通大學(xué)長聘教軌副教授朱勃和長聘教授陳功友為論文的共同通訊作者。朱勃博士2017年以長聘教軌副教授任職交大農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院。該研究得到了科技部重點研發(fā)(項目編號2017YFD0201108和2018YFD0201202)等項目的資助。
論文鏈接:https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009762