近日，中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室在魚(yú)類(lèi)種質(zhì)資源基因標(biāo)記開(kāi)發(fā)方面取得新進(jìn)展，相關(guān)成果以“FishPIE: A universal phylogenetically informative exon markers set for ray-finned fishes”發(fā)表于Cell旗下期刊《iScience》。

 

　　依托國(guó)家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)珠江分庫(kù)（掛靠單位中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所）保存的魚(yú)類(lèi)基因資源和數(shù)據(jù)資源，從131種魚(yú)類(lèi)基因組數(shù)據(jù)中篩選出直系同源基因，通過(guò)對(duì)31個(gè)目203個(gè)物種的PCR引物特異性和PCR擴(kuò)增效率進(jìn)行進(jìn)一步篩選，初步開(kāi)發(fā)了82個(gè)魚(yú)類(lèi)通用型核基因分子標(biāo)記（FishPIE），并構(gòu)建了魚(yú)類(lèi)60個(gè)目190個(gè)科710種魚(yú)類(lèi)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，得到了與使用數(shù)百個(gè)標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當(dāng)?shù)姆直媛省Ｐ聵?biāo)記的開(kāi)發(fā)應(yīng)用，可以實(shí)現(xiàn)對(duì)魚(yú)類(lèi)種質(zhì)的快速分類(lèi)和鑒定，在保障準(zhǔn)確率的前提下，降低了現(xiàn)有技術(shù)耗時(shí)、費(fèi)力、成本高的問(wèn)題，同時(shí)為魚(yú)類(lèi)系統(tǒng)發(fā)育提供了一種新方案，豐富了基于分子標(biāo)記對(duì)魚(yú)類(lèi)系統(tǒng)發(fā)育研究的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

 

　　研究工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2018YFD0900705），中國(guó)-東盟海上合作基金（CAMC-2018F））和國(guó)家淡水水產(chǎn)種質(zhì)資源庫(kù)（FGRC18537）等項(xiàng)目資助。牟希東、楊葉欣和孫金輝為共同第一作者，牟希東和中山大學(xué)馬嘉欣為共同通訊作者。

 

　　原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974