中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所雞遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)圍繞雞異嗜性粒細(xì)胞與淋巴細(xì)胞比值(H/L)選擇系的抗菌機(jī)制開(kāi)展了多組學(xué)聯(lián)合分析,在雞抗病力遺傳機(jī)理解析方面取得重要進(jìn)展,為我國(guó)地方雞種抗病力性能評(píng)估和功能基因的挖掘與應(yīng)用提供了重要參考。相關(guān)成果發(fā)表在《通訊生物學(xué)(Communications Biology)》、《農(nóng)業(yè)科學(xué)學(xué)報(bào)(Journal of Integrative Agriculture)》和《免疫學(xué)前沿(Frontiers in Immunology)》上。
據(jù)趙桂蘋研究員介紹,H/L比值和雞的抗病抗應(yīng)激能力負(fù)相關(guān),團(tuán)隊(duì)前期以京星黃雞為素材,構(gòu)建了低H/L定向選育系,9個(gè)世代定向選擇后,群體H/L值由0.5降低至0.25,群體遺傳結(jié)構(gòu)有所分化。研究發(fā)現(xiàn)低H/L選育系具有更強(qiáng)的抗沙門氏菌能力,但H/L如何調(diào)控先天免疫水平的遺傳機(jī)制尚不明晰。通過(guò)構(gòu)建F2分離群體,結(jié)合GWAS分析,鑒定到 PTPRJ 基因與H/L比值相關(guān),并證明rs73679947位點(diǎn)CC為優(yōu)勢(shì)基因型。該位點(diǎn)變異位于增強(qiáng)子區(qū)域,相關(guān)位點(diǎn)突變后,增強(qiáng)子作用減弱,導(dǎo)致 PTPRJ 基因表達(dá)下調(diào)。 PTPRJ 基因低表達(dá)抑制下游 LYN 、 SHP1 、 SHIP1 等基因表達(dá),導(dǎo)致對(duì)異嗜性粒細(xì)胞功能的抑制作用減弱,從而提高機(jī)體抗沙門氏菌能力。
雞外周血巨噬細(xì)胞細(xì)胞是影響雞H/L比值重要因素,且其吞噬作用構(gòu)成了先天免疫的強(qiáng)大屏障。通過(guò)對(duì)不同雞種巨噬細(xì)胞細(xì)胞功能比較分析發(fā)現(xiàn),大骨雞外周血巨噬細(xì)胞吞噬能力強(qiáng)于文昌雞,且二者巨噬細(xì)胞細(xì)胞的差異表達(dá)基因富集于沙門氏菌感染、吞噬體等免疫相關(guān)信號(hào)通路。WGCNA分析發(fā)現(xiàn),細(xì)胞代謝和氧化磷酸化信號(hào)通路與巨噬細(xì)胞吞噬作用相關(guān)。全基因組選擇性清除分析顯示,與巨噬細(xì)胞相關(guān)的 H2AFZ 等基因在兩品種中明顯分化。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研項(xiàng)目、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、海南省崖州灣種子實(shí)驗(yàn)室等項(xiàng)目資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s42003-023-04559-x
https://www.researchgate.net/publication/359528152
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9941738/