近日,中國水產科學研究院北戴河中心實驗站牙鲆遺傳育種創(chuàng)新團隊在牙鲆無眼側黑化性狀研究方面取得新進展,相關研究成果以“Identification candidate genes and loci associated with hypermelanosis of the blind side in Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) using the combination of RNA-Seq and BSA-Seq”為題發(fā)表于《Aquaculture》(JCR 1區(qū)期刊,IF:3.9,全文網(wǎng)址為:https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2024.741583)。團隊劉名揚研究實習員、傘利擇研究實習員為第一作者,侯吉倫研究員、王桂興副研究員為通訊作者。
在牙鲆工廠化養(yǎng)殖過程中,無眼側皮膚黑化嚴重影響其經(jīng)濟價值。雌核發(fā)育作為一種可有效提升遺傳同質性并固定特定性狀的技術,被廣泛地應用于魚類遺傳育種研究中。在本研究中,團隊利用雌核發(fā)育技術制備了正常和無眼側皮膚黑化牙鲆的重組雙倍體群體,構建了皮膚轉錄組文庫和BSA-seq的分離池(Po_N和Po_H)。通過RNA-seq和BSA-seq相結合,篩選到5個InDel和3個SNP,經(jīng)204尾個體基因型驗證和qRT-PCR實驗證明候選基因ca4a和mreg中的3個位點與該性狀顯著相關。研究結果為解析牙鲆無眼側黑化的分子機制以及全白底板牙鲆的選育提供了重要的支撐。
本研究得到中國水產科學研究院基本科研業(yè)務費(2023TD41)、河北省重點研發(fā)計劃(21326307D)、河北省自然科學基金(C2023107012)、國家海水魚產業(yè)技術體系(CARS-47)和國家海洋水產種質資源庫等項目的資助。
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